Program Jangka Panjang

1. Menjadikan lulusan SMK Muhammadiyah Loa Janan bertaqwa, berakhlak mulia, cerdas, trampil, dan berbudi pekerti luhur
2. Mewujudkan sekolah yang berprestasi baik bidang akademik maupun non akademik
3. Menjadikan SMK Muhammadiyah Loa Janan sekolah swasta terbaik di Kecamatan Loa Janan dan Loa Kulu
4. Menyiapkan lulusan SMK Muhammadiyah Loa Janan memasuki dunia kerja dan era globalisasi

Program Jangka Menengah

1. Sekolah Memiliki dan mencapai standar kurikulum
2. Sekolah memiliki dan mencapai standar pendidikan dan tenaga kependidikan
3. Sekolah memiliki dan mencapai standar proses pembelajaran
4. Sekolah memiliki dan mencapai standar sarana prasarana/fasilitas sekolah
5. Sekolah memiliki dan mencapai standar pencapaian ketentutasa, kompetensi, prestasi akademik dan non akademik serta lulusan berbudi pekerti baik (berakhlak mulia)
6. Sekolah memiliki standar pengelolaan sekolah
7. Sekolah memiliki dan mencapai standar pembiayaan pendidikan
8. Sekolah memiliki dan mencapai standar penilaian
9. Sekolah memiliki suasana yang bersih, indah, rapi, nyaman, dan aman
10. Sekolah memiliki manajemen berwawasan pendidikan Budi Pekerti
11. Sekolah memiliki Team kesenian daerah
12. Sekolah memiliki team sepak bola, Volly Ball dan olah raga lainnya yang handal.